Por experiencia personal, debes dejar lo especificado en el contrato, el parquet puedes desmontarlo y llevártelo en caso de no quererte renovar, ya que si no está especificado y no es un elemento fijo, puedes desmontar facilmente sin dejar el local con menos de lo que había, es decir, si había bladosas y pones otras encima, al ser obra has de dejarlas, al ser parquet, si no estropeas las baldosas te lo puedes llevar. igual con la barra de un bar, si no está en contrato, puedes llevarte si la pared de la barra es de obra y la barra en sí de inox, puedes desmontar el inox  le dejas la pared de la barra. Si es un propietario inteligente y tu buen inquilino pagador, no deberías tener problema en renovar, por lo que lo hablado no es de mayor relevancia. Esto se hace porque como a mi me ha pasado, me han destrozado el local al abandonarlo y si no lo tienes todo bien firmado, pierdes mucho dinero como dueño del local.

Lo mismo que comenta el compañero, deben quedarse en el local, ya que lo has hecho para un beneficio tuyo (que el local esté mejor). Depende de cómo vaya con la propiedad cuando venza el contrato, creo que sí que se podría usar para que vean que cuidas el local cara a la renovación, pero sin poder exigir como moneda de cambio.
Un saludo

Si el contrato dice que al término del contrato todas las mejoras deben quedarse, no puedes llevarte nada de nada de forma legal. Por tanto, no tienes margen alguno de negociación.