Intenta conseguir anular los contratos anteriores y hacer un nuevo contrato incluyendo a la pareja como inquilinos solidarios, mejor bajo la supervisión de un abogado experto en arrendamientos urbanos. Si no te pagan y no tuviste la precaución de pedir garantías de solvencia antes de hacer los contratos, lo tienes mal, tendrás que asumir los riesgos. 

Me pagaron solo una fianza , el tema es en caso de impagos o otra cosa puedo reclamar a los dos o solo uno bastaria por que en realidad son el mismo contrato

Dos contratos requiere dos fianzas ¿ las pagaron?
Cuando se desconoce como actuar, hay que acudir a un profesional pidiendo asesoramiento, ya que luego como ocurre en el presente caso, el embrollo ya está montado.  A mi parecer, salvo superior criterio, la solución  consiste en redactar un nuevo contrato, dejando sin efecto los anteriores o hacer un documento firmado por las tres partes, indicando que por error se hicieron dos contratos sobre el mismo piso, mismas fechas, mismas condiciones y mismos arrendatarios por separado, siendo estos una pareja que seguirán como tales cohabitando  en dicha vivienda.