Ley de Arrendamientos Urbanos 1994
Artículo 22 - Obras de mejora (si la obra fuera de mantenimiento aplica otro artículo)
3. El arrendatario que soporte las obras tendrá derecho a una reducción de la renta en proporción a la parte de la vivienda de la que se vea privado por causa de aquéllas, así como a la indemnización de los gastos que las obras le obliguen a efectuar.

Si has estado fuera, por comodidad, será distinto a si has estado fuera porque fuera imposible estar dentro. En este último caso, es decir, si no se podía utilizar ninguna parte de la vivienda, entonces no tienes que pagar esas 3 semanas, y, además deberán compensarte si incurriste en algún gasto a causa de las obras.
Si la obra fue sólo.... en el baño, deberéis llegar a un acuerdo tu arrendador y tú para valorar qué porcentaje del alquiler es el baño, y descontar ese porcentaje en 3/4 partes.